含硫廢水的生化處理
經物化處理后的含硫廢水往往仍含有一定量的硫，而且一般出水COD和氨氮超標，因此在物化處理的基礎上，常常還需進一步作生化處理。但由于硫對生化系統有毒害作用，因此須注意采用適宜工藝以解除硫離子對微生物的抑制。
有氧生物氧化
在含硫廢水的生化處理中，菌種的選取是一個很關鍵的問題。只有選擇那些在細胞外形成單質硫的細菌作為含硫廢水處理的菌種，才能達到所需的處理效果，并且還應避免在生物作用過程中，硫化物轉化成硫酸鹽。研究表明，通過控制硫化物與氧的比例、硫化物濃度及硫化物的污泥負荷，用無色硫細菌在有氧的條件下氧化硫化物，最終可將硫化物氧化為單質硫，以及少量硫酸鹽。
1993年荷蘭Paques公司首次用Thiopaq工藝，采用無色硫細菌以一定的生產規模去除經厭氧處理的造紙工業含硫廢水．經不斷改進，已在生物脫硫領域得到應用．該工藝的核心是一個具有專利權的氣升式生物反應器，在該反應器中，硫細菌在接近常溫常壓條件下將硫化物氧化成單質硫。該法采用稀碳酸鈉溶液吸收H2S，生成NaHS，與常規方法利用NaOH溶液吸收HzS相比，避免了對吸收液的二次處理，節省了費用。
生物接觸氧化法又稱固定式活性污泥法，它兼有活性污泥和生物膜法的優點．楊柳燕等人用二段生物接觸氧化法對經汽提后的含硫廢水進行了中試研究。結果表明生物接觸氧化法處理含硫廢水對進水水質變化的適應能力較強，出水水質穩定，污泥生成量少，不產生污泥膨脹的危害．此外，該法生物膜上的生物相豐富，除細菌外，還存在求異菌屬的絲狀菌、多種菌屬的原生、后生動物，容易形成穩定的生物系。
缺氧生物處理
研究人員在生物處理硫化物的實驗研究中，采用光合細菌進行厭氧氧化，將硫化物氧化為單質硫去除。Murtuza等人報道利用綠硫菌(GSB)，使用內徑為1．6mill的Tygon材質管固定膜連續流光生物反應器處理含硫化氫廢水。最大含硫負荷可達1451mg/Ih，停留時間僅需6．74min，S2一基本去除。該技術需要大量輻射能，且當廢水中出現硫顆粒后，透光度會大大降低，影響處理效果。
利用反硝化細菌氧化硫化物是另一種缺氧生物處理，但反應中需要硝酸鹽，限制了該技術的使用。
其它生物處理技術
國外研究人員采用生物固定化技術對含硫廢水進行了試驗研究．德國科技工作者將降解硫磷等9種農藥的酶，以共價結合法固定于多孔玻璃及硅珠上，制成酶柱處理硫磷廢水，去除率可達95%以上，且可連續工作70d，而酶活性無明顯損失。
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